Fragmen Polimorfik Penanda RAPD untuk Analisis Genetik Sengon (Falcataria Moluccana) = Polymorphic RAPD Fragments for Genetic Analysis of Sengon (Falcataria moluccana)
This research was conducted to support tree improvement program for sengon (Talcataria moluccana (Miq.) Barneby & J. W. Grimes). Polymorphic fragments were surveyed in 288 RAPD primers using 24 materials from Okinawa, Japan. Carefully selections of the polymorphic fragments were applied to overcome a problem of low reproducibility of RAPD markers. The first screening using 4 materials found that 285 out of 288 primers successfully produced fragments. The second screening using 16 materials finally obtained 48 polymorphic fragments. High discrimination ability (DP=0.483, in average) was obtained from all the selected fragments. The selected fragments can be used to support tree improvement program of the species for genetic diversity study and to facilitate a development of more specific markers such as Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) marker.
= Penelitian ini dilakukan untuk mendukung program pemuliaan pohon sengon (Falcataria moluccana (Miq.) Bameby & J.W. Grimes). Fragmen polimorfik didapatkan dengan melakukan seleksi pada 288 RAPD primer menggunakan 24 sampel dari Okinawa, Jepang. Seleksi pertama menggunakan 4 sampel menunjukkan bahwa 285 primers menghasilkan fragmen dan dapat dilanjutkan ke seleksi kedua. Setelah melakukan seleksi dan pemilihan fragmen dengan kriteria yang ketat untuk menghindari masalah reprodusibilitas yang rendah di penanda RAPD, 48 fragmen polimorfik akhirnya diperoleh. Fragmen yang terpilih mempunyai kemampuan identifikasi yang baik ditandai dengan tingginya nilai Discrimination Power (rata-rata DP=0,483). Hasil penelitian ini dapat diaplikasikan untuk studi keragaman genetik dan dapat dikembangkan lebih lanjut menjadi penanda yang lebih spesifik seperti penanda Sequence Characterized Polymorphic Region (SCAR).
Tidak ada salinan data
Tidak tersedia versi lain