Pengujian Kartu FTA sebagai Alat Sampling DNA Jamur Patogen dari Berbagai Bagian Tanaman yang Terinfeksi, Assessing FTA card for fungal pathogen DNA capture from different types of infected plant material

FTA card offers a simple and fast method for retrieval of DNA samples at room temperature and storage of DNA in the short and long term. This will facilitate the detection and identification of plant pathogens rapidly; increasing the number of samples can be collected, stored and transported in the field, especially from remote locations. The purpose of this study is to investigate the suitability of FTA cards as a new method for sampling DNA from multiple infected of plant tissues such as leaves, bark and roots. The results of this study shows that the FTA card suitable for use as one method of sampling because its quick and accurate. Series of PCR using ITS1F/ITS4 and ITS3/ITS4 primer pairs were done to detect the fungal DNA from the FTA card. Nested PCR has been done using species-specific primers to identify the fungus without cloning. Optimization of methods to maximize the use of FTA cards as a method of sampling and DNA extraction which is simple, fast, accurate and safe for the environment is still needed.
= Kartu FTA menawarkan metode yang sederhana dan cepat untuk pengambilan sampel DNA pada suhu kamar dan penyimpanan DNA dalam jangka pendek dan panjang. Hal ini akan memudahkan deteksi dan identifikasi patogen tanaman dengan cepat; meningkatkan jumlah sampel dapat dikumpulkan, disimpan dan diangkut di lapangan, terutama dari lokasi terpencil. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menyelidiki kesesuaian kartu FTA sebagai metode baru untuk DNA sampling dari beberapa jaringan tanaman terinfeksi seperti daun, kulit kayu dan akar. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kartu FTA sesuai untuk digunakan sebagai salah satu metode sampling, karena cepat dan akurat. PCR menggunakan pasangan primer ITS1F/ITS4 dan ITS3/ITS4 dilakukan untuk mendeteksi DNA jamur dari kartu FTA. Nested PCR juga dilakukan menggunakan primer spesies-spesifik untuk mengidentifikasi jamur tanpa melakukan kloning. Optimalisasi metode untuk memaksimalkan penggunaan kartu FTA sebagai salah satu metode sampling dan ekstraksi DNA yang sederhana, cepat, akurat dan aman bagi lingkungan masih diperlukan.

Ketersediaan

Tidak ada salinan data

Informasi Detil

Judul Seri

Jurnal Pemuliaan Tanaman Hutan

No. Panggil

//

Penerbit

: ., 2011

Deskripsi Fisik

93-104

Bahasa

English

ISBN/ISSN

16937147

Klasifikasi

//

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subyek

-

Info Detil Spesifik

Perpustakaan R.I. Ardi Koesoema

Pernyataan Tanggungjawab

-

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas